本學系自民國80年度設立，歷經「國立屏東商業專科學校」時期，後改制為「國立屏東商業技術學院」，在民國103年與「國立屏東教育大學」併校後，現隸屬於「國立屏東大學管理學院」。

本學系秉持的教育理念為：

(一)強調技職教育特色；

(二)堅持教育品質；

(三)理論與實務的結合教育；

(四)回饋社會服務地方；

(五)強調專業道德的重要性。

而教育目標係：

(一)為會計服務業、中小企業及公部門培育會計專業人才；

(二)結合理論與實務，提供在地產業相關專業知識並規劃校外實習與參訪及舉辦實務專題演講等活動；

(三)具備管理新知、獨立思考及解決問題的能力；

(四)具有敬業精神、專業道德的操守及國際化的宏觀。

本系的重點特色包含：

(一)多數具會計師證照及實務經驗的師資；

(二)開設記帳士專業考照課程及總整課程；

(三)學生參與各項校外實習計劃；

(四)輔導考取電腦稽核證照及各項專業證照。

就讀本學系學生未來發展：

(一)從事會計師或記帳士專業服務工作；

(二)考取公職或國營事業會計人員；

(三)擔任民營企業會計人員；

(四)繼續深造攻讀研究所。